Une nouvelle base de données nationale sur la diversité génétique des populations d'espèces sauvages

Contexte: La diversité génétique est une composante essentielle de la biodiversité et est considérée comme un facteur clef pérennisant les populations dans un environnement changeant et de l'adaptation aux événements extrêmes. La convention mondiale sur la diversité biologique (CDB) impose aux pays d'évaluer, de surveiller et, à terme, d'enrayer la perte de diversité génétique. Cependant, il n'existe pas de collecte systématique de données génétiques intraspécifiques adaptée aux besoins des pratiques de conservation et susceptible de soutenir ce processus.

Objectif: Le projet GenDiB a réalisé une analyse des besoins et de la faisabilité d'une nouvelle base de données nationale contenant des données géoréférencées sur la diversité génétique intraspécifique dans les populations d'espèces sauvages en Suisse, et développe actuellement un prototype de base de données.

Le concept développé dans le cadre du projet établit les fondements à la création d'une base de données nationale contenant des ensembles de données géoréférencées sur la diversité génétique intraspécifique des populations naturelles en Suisse. Une telle base de données fournit une connaissance indispensable pour évaluer les modèles spatiaux de diversité génétique intraspécifique dans un large éventail d'espèces, pour identifier les populations et les zones importantes pour la conservation de la diversité génétique, et pour évaluer les changements temporels ou les effets des extremes environnementaux. Ces informations doivent contribuer à l'élaboration et à l'amélioration des mesures de conservation. En outre, ces données peuvent être rendues accessibles à des fins d'enseignement et de recherche.

Développements actuels: Nous avons effectué une recherche bibliographique pour recenser les ensembles de données existants sur la diversité génétique des populations naturelles en Suisse. En outre, nous menons une enquête auprès des chercheurs pour tenter de rendre accessibles des ensembles de données non publiées auparavant (par exemple des thèses de licence, de maîtrise ou de doctorat). Ces ensembles de données seront complétés en permanence. Si vous êtes en possession d'autres ensembles de données, nous vous invitons à nous contacter directement et à partager cette information avec les collègues intéressés.

Les attributs des ensembles de données nécessaires à notre travail sont rassemblés dans un tableau qui peut être obtenue par courrier électronique

Les données collectées sont regroupées par espèce et les localités sont représentées sur une carte interactive. Cette carte est librement accessible via notre page web de projet et contiendra des liens vers les données et les articles.

Pour toute question ou suggestion, n’hésiter pas à nous contacter.

Références:

Buser C, Mosimann M, Iosifescu-Enescu I, Woodcock S, Gugerli F 2023. Utilisation d’une banque de données nationale sur la diversité génétique intraspécifique pour la pratique de la conservation. N & L inside 2/23: 33–40.

Leigh DM, Vandergast AG, Hunter ME, Crandall ED, Funk WC, Garroway CJ, Hoban S, Oyler-McCance SJ, Rellstab C, Segelbacher G, Schmidt C, Vázquez-Domínguez E, Paz-Vinas I. Best practices for genetic and genomic data archiving. Nat Ecol Evol (2024). doi.org/10.1038/s41559-024-02423-7

Mieux utiliser les données génétiques dans Institut fédéral de recherches WSL (2024) Si petits et si importants: explorer les micro-univers. Magazine du WSL Diagonale, 2024/2: 40 p.