Eine neue nationale Datenbank zur genetischen Vielfalt in Populationen wildlebender Arten
Ionut Iosifescu Enescu
Corine Buser
Evangelia Kolovou, Benjamin Dauphin, Rolf Holderegger, Deborah Marie Leigh, Rolf Meile, Gian-Kasper Plattner, Christian Rellstab, Silvia Stofer, Lukas Wotruba
2022 - 2026
Kooperation FinanzierungGenDiB ¶
Hintergrund: Die genetische Vielfalt ist ein wesentlicher Bestandteil der biologischen Vielfalt und gilt als Schlüssel für den Fortbestand von Populationen in einer sich verändernden Umwelt sowie für die Anpassung an extreme Ereignisse. Das weltweite Übereinkommen über die biologische Vielfalt (CBD) verpflichtet die Länder, den Verlust der genetischen Vielfalt zu bewerten, zu überwachen und letztendlich zu stoppen. Es gibt jedoch keine systematische Erfassung innerartlicher genetischer Daten, die auf die Bedürfnisse der Naturschutzpraxis zugeschnitten ist und diesen Prozess unterstützen könnte.
Ziel: Das Projekt GenDiB führte eine Bedarfs- und Machbarkeitsanalyse über eine neue nationale Datenbank mit georeferenzierten Daten zur intraspezifischen genetischen Vielfalt in Populationen wildlebender Arten in der Schweiz durch, und entwickelt nun einen Datenbankprototyp.
Das im Rahmen des Projekts entwickelte Konzept bildet die Grundlage, um eine nationale Datenbank mit georeferenzierten Datensätzen zur innerartlichen genetischen Vielfalt von natürlichen Populationen in der Schweiz aufzubauen. Eine solche Datenbank bietet die Grundlage, um räumliche Muster von innerartlicher genetischer Diversität in einem breiten Spektrum von Arten zu bewerten, um Populationen und Gebiete zu erkennen, die für die Erhaltung der genetischen Vielfalt wichtig sind, und um zeitliche Veränderungen oder Auswirkungen von Extremen zu bewerten. Diese Information soll dazu beitragen, Erhaltungsmassnahmen zu entwickeln und zu verbessern. Darüber hinaus können diese Daten für Lehrzwecke zugänglich gemacht werden.
Aktuelles: Um die bereits vorhandenen Datensätze zur genetischen Vielfalt in natürlichen Populationen in der Schweiz zu erfassen führten wir eine Literaturrecherche durch. Ergänzend dazu machen wir eine Umfrage bei Forschenden und versuchen so, auch bisher unveröffentlichte Datensätze zugänglich zu machen (z.B. BSc, MSc, PhD Arbeiten). Diese Datensätze werden fortlaufend ergänzt. Falls Sie im Besitz weiterer Datensätze sind können Sie sich gerne direkt an uns wenden und diese Informationen mit interessierten KollegInnen teilen.
Die für unsere Arbeit benötigten Attribute zu den Datensätzen sind in einer Tabelle zusammengestellt, die hier heruntergeladen werden kann. Die ausgefüllte Tabelle kann per Email an uns retourniert werden.
Die gesammelten Daten werden nach Arten gruppiert und die Lokalitäten in einer interaktiven Karte dargestellt. Diese Karte ist über unsere Projektseite frei zugänglich und enthält Links zu den Daten und Artikeln.
Bei Nachfragen und Anregungen erreichen Sie uns am besten via Email.
Referenzen:
Buser C, Mosimann M, Iosifescu-Enescu I, Woodcock S, Gugerli F 2023. Nutzen einer nationalen Datenbank zur innerartlichen genetischen Vielfalt für die Naturschutzpraxis. N & L inside 2/23: 33–40.
Leigh DM, Vandergast AG, Hunter ME, Crandall ED, Funk WC, Garroway CJ, Hoban S, Oyler-McCance SJ, Rellstab C, Segelbacher G, Schmidt C, Vázquez-Domínguez E, Paz-Vinas I. Best practices for genetic and genomic data archiving. Nat Ecol Evol (2024). doi.org/10.1038/s41559-024-02423-7